地名由来：因镇政府驻地村名而得名。原为胡苏亭，秦、东魏、唐、金曾为胡苏、临津县城驻地。金太宗天会六年（1128）因水患城毁，县治东迁，此地为保安镇，清朝为包·头店，后称为保店。

2021年12月，保店镇被认定为第二批山东省乡村振兴示范乡（镇、街）。

2020年12月，山东省农业农村厅公布2020年山东省农业产业强镇名单，保店镇榜上有名。

2020年12月，保店镇入选2020年度山东省省级文明村镇社区名录。

2019年7月，保店镇入选2019年全国农业产业强镇建设名单。

宁津县保店镇是驴肉的生产基地，在全国食品评比会上荣获部优产品。近年来，保店镇党委政府非常重视这一历史名优产品，把驴肉作为振兴农村经济重点项目来抓，建立了养殖屠宰、深加工一条龙的生产基地，保店驴肉已注册""保店牌""商标，被国家绿色食品发展中心评为""绿色食品""。

招商政策：

1、凡来保店镇投资办企业，优先安排场地，

2、对投资新上项目，经县验资确认，自投资之日起，投资100万元以上的可免收所得税务2年，500万元以上的，所得税""免二减三""。

3、对来本镇开发建设的，实行特殊保护政策，有工商、税务、公安、司法、电业、邮电等地方职能部门提供全方位服务。

4、凡来本镇办企业的单位和个人，所需要的各种手续由镇政府协调各部门同意办理，期限不超过10天。

5、鼓励单位和个人为保店镇引进项目、技术和资金；凡引进项目投产的，经县验资确认，按项目固定资产投资额的1%给予奖励；引进有偿资金的，按到位资金的3-5%给予奖励；引进技术的，按引进技术所创造的经济效益，由受益单位给予奖励。

6、来保店镇兴办企业固定资产50万元以上的为全家办理农转非，优先解决子女入托上学等实际问题。

历史沿革：

1956年撤区并乡，为保店乡，隶属宁津县。

1958年实行政社合一，成立红旗公社。

1961年改名为保店公社。

1984年政社分开，成立保店镇。

2000年张宅乡并于保店镇至今。