地名由来：民国三年张謇集股建立“大有晋垦牧公司”，开垦三份荒地，留一份搞盐业，即“垦三余一”；又因公司地处余东、余中、余西三盐场之北，故名三余。

2023年10月，2023年全国综合实力千强镇名单发布，三余镇位列第594位。

2021年10月，三余镇上榜2021年全国千强镇名单，排名第602位。

2012年12月，环境保护部授予三余镇2010—2011年度国家级生态乡镇称号。

通州市辖镇。1957年为新余乡，1958年更名三余公社，1983年改乡，1984年乡镇合并设三余镇。位于市境东北部，距市府30公里。面积40.4平方公里，人口3.8万。省道掘青公路与金三公路在境内交会，团结河与三余竖河交错。辖菜园、三余、齐乐、中义、大乐、斗争、贡安、光荣、大兴、中心、镇北、红专、红星、前进、合力、立新、镇西、士文、新民、镇东、一社、永兴、新南23个村委会和镇北、中心2个居委会。农业以种植粮、棉为主，鳗鱼苗、文蛤为特产。企业产品有油咀、油泵、高档皮毛机。

张謇[jiǎn]（1853年7月1日～1926年8月24日），字季直，号啬庵，汉族，祖籍江苏常熟，生于江苏省海门市长乐镇（今海门市常乐镇）。清末状元，中国近代实业家、政治家、教育家，主张“实业救国”。中国棉纺织领域早期的开拓者，上海海洋大学创始人。张謇创办中国第一所纺织专业学校，开中国纺织高……

大有晋垦区格局

大有晋垦区格局位于通州湾示范区三余镇向阳街（三余镇粮食管理所内），为南通市文物保护单位。保护范围：整个院落。建设控制地带：周边为建成民宅或农田，不适宜划定建设控制地带。

三门闸

三门闸位于通州湾示范区三余镇恒兴至环本遥望港南侧三门闸河，为南通市文物保护单位。保护范围：东西向覆盖整个桥面。建设控制地带：周边为水面或道路，不需要划定建设控制地带。

历史沿革：

民国三年张謇集股建立“大有晋垦牧公司”废灶兴垦，筑堤建闸，划框分窕，种青改壤，久而久之便形成了三余镇。

1958年建立三余人民公社。

1962年镇社分治，建三余、北兴桥、恒兴三个人民公社，同时建三余镇。

1983年三余公社改设三余乡，1984年撤三余乡与三余镇合并，统称三余镇。

2001年忠义乡并入。

2007年2月北兴桥、海晏并入成立现在的三余镇。