地名由来：原名店门，后因剡姓居此，渐成剡门，远门系剡门演化之称，故而得名远门镇。

2021年12月，甘肃省爱卫会命名远门镇为2021年度甘肃省卫生乡镇（街道）。

清水县辖乡。

1954年设远门区，1961年设公社，1984年置乡。位于县境西部，距县城22公里。面积62平方公里，人口1.1万。天(水)陇(县)公路南北穿境，设有汽车站。辖远门、夜明、刘寨、单魏、庙台、安业、林峡、梨林、赵瞿、王付、大湾、铁炉、陈新、新石、后沟、团庄16个村委会。农业主产小麦、玉米、薯类，盛产胡麻、苹果。

历史沿革：

民国元年（1912年）后，属天水县。

1954年，划归清水县，设远门区。

1958年，属白驼公社远门管理区。

1961年，设远门公社。

1965年，王付公社全部及梨林、化岭公社部分并入远门公社。

1983年，改为远门乡。

2017年3月，撤乡设镇。