地名由来：因镇政府驻南屯村而得名。

涞源县辖乡。1958年成立光明公社，1961年改南屯公社，1984年改乡。位于县城东南，距县城9公里。面积70.6平方公里，人口1万。辖南屯、杜村、宋家庄、大炉沟、小炉沟、亚家庄、马圈、张家庄、黑山、胡家庄、金家庄、上沟、曹家庄、朱家庄、湖海15个村委会。农业主产玉米、谷子，有少量稻田。有铁、铅锌矿开采。有明长城39公里。

2013年，涞源县撤销南屯乡，设立南屯镇。