地名由来：甲居，藏语是百户人家之意。

2021年5月，省委宣传部命名甲居镇为四川省首批省级乡村文化振兴样板村镇。

2021年3月，四川省首批乡村治理示范镇名单出炉，甲居镇上榜。

2020年9月，甲居镇入选四川省第四批省级森林小镇。

2019年，将原聂呷乡（除甲居三村佛爷岩片区）和巴旺乡聂拉村、小巴旺村、小聂呷村所属行政区域划归甲居镇管辖，甲居镇人民政府驻聂呷村4组17号。

历史沿革：

2019年12月，四川省人民政府关于同意甘孜州调整康定市等6个县（市）部分乡镇行政区划的批复，撤销东谷乡、水子乡、东女谷乡、聂呷乡和岳扎乡，设立东谷镇、墨尔多山镇和甲居镇。