地名由来：因周边地势较低，中间较高垅起，得名。

2022年3月，江西省爱国卫生运动委员会命名高垅乡为2021年度江西省省级卫生乡镇。

从九江市濂溪区海会镇析出高垅、庐山水泥厂、五星、双垅、银门、谷山、青山等7个村（居）委会，设立九江市濂溪区高垅乡，乡政府驻高垅居委会。

历史沿革：

1949属星子县积余乡。

1956年区乡合并，分属海会沿湖、九星乡。

1957年划归庐山管理局所辖的庐山综合垦殖场海会分场。

1958年撤乡建社，隶海会公社。

1959年成立高垅公社，次年并入海会公社。

1962年分设，1964年再度并入。

1966年海会公社更名东风公社。

1969年复归星子县，1970年复隶庐山管理局。

1977年两社再度分设，高垅公社与青山垦殖场、庐山水产场合一，1979年社场分离。

1980年5月隶省辖九江市郊区。

1984年恢复乡置为高垅乡。

2002年1月与海会镇合并。

2016年5月，根据《国务院关于同意江西省调整九江市部分行政区划的批复》（国函〔2016〕58号）精神，江西省政府经研究，撤销星子县，设立县级庐山市，九江市庐山区更名为濂溪区。

从海会镇析出高垅、庐山水泥厂、五星、双垅、银门、谷山、青山7个村（居）委会，设立九江市濂溪区高垅乡，乡政府驻高垅社区居委会。