地名由来：咸丰年间已经成集市，因大量种植与经营中药材甘草，又是西安通住兰州的重要驿站，开设多处车马店、旅店、饭店，故名为甘草店镇。

2023年3月，甘草店镇被授予甘肃省第十六批省级文明村镇称号。

甘草店镇位于榆中县东南部，地处苑川河中游，距县城25公里。北靠韦营乡，南连高崖镇，西依清水驿乡，东邻定西安定区。东西长约16公里，南北宽约15.6公里，总面积121.48平方公里。全镇辖13个行政村84个村民小组。甘草店镇，是历史上甘肃中部的重要交通枢纽，是连接甘、陕、川、青的“旱码头”，也是丝绸之路的必经之路。据史料记载，甘草店在旧石器时代就有先民居住，上古时为羌、戌住地。汉武帝元朔二年（前127年），属榆中县。据西北师大历史系教授陈守忠考证：十六时国西秦乞伏国仁所筑勇士城及后来的子城都在甘草店。清咸丰年间（公元1851年—1861年）甘草店已有集市，由于该地盛产中药甘草，陕西药商经常云集此地，收购甘草，并开设“万和堂”等多家国药店，作为向全国销售甘草的集散市场。当地居民为便于旅商住宿、饮食、应运而开设多处马车店、饭店。因为该地适居西安通往兰州古道重要驿站，往返驿使均经此投宿，故双关语为甘草店。

历史沿革：

民国元年（1912年），设甘草店镇。

1949年，升为甘草店区。

1955年9月，撤区并乡降为甘草店乡。

1958年，为高崖公社甘草店大队。

1961年，析出建甘草店公社。

1965年，车道岭公社并入。

1983年，改甘草店乡。

1998年，撤乡建镇。