地名由来：据《束鹿县志》记载，战国时大将智伯葬于此地。因村建于智伯墓南，故名南智丘。清光绪时改为南智伯，后又改南智丘，沿用至今。

2023年10月，南智邱镇被确定为第一批河北省乡村治理示范乡镇。

2019年10月，2019年度全国综合实力千强镇榜单公布，南智邱镇位列第505名。

2014年7月，南智邱镇被国家住房城乡建设部等七部委确定为全国重点镇。

南智邱镇有10219户，人口为38709人，拥有耕地80225亩，辖南智邱、南瓦、南棚、南耿庄、大车城、小车城、耿虔寺、北智邱、赵马、北张光、南张光、西小王、盂观、西城、东小王、西曹家庄、西陈家庄、东陈家庄、北瓦、褚家庄、朗口、漫河头、泗上、新兴路.

历史沿革：

战国时期，南智邱镇境域属于晋国。

清光绪年间至中华人民共和国成立后，属束鹿县。

1958年，分属西小王公社南智邱管理区、小车城管理区。

1961年，析出，成立南智邱公社。

1984年1月，改为南智邱乡；同年，撤乡置镇。

1996年，西小王乡并入。