地名由来：因辖内在清代曾有三元巷，故名。

2021年11月，广州市住房和城乡建设局确定三元巷社区为广州市2021年绿色社区。

三元巷社区是广东省广州市越秀区光塔街道下辖的社区，城乡分类代码为111，为主城区。区划代码为440104007122，居民身份证号码前6位为440104。邮政编码为510030，长途电话区号为020，车牌号码为粤A。三元巷社区与福地巷社区、温良里社区、陶家巷社区、七株榕社区、观绿社区、祝寿巷社区、孝友东社区、象牙北社区、杏花巷社区、怡乐里社区、和义巷社区、回龙里社区、云台里社区、师好巷社区相邻。

历史沿革：

1954年属海珠北街管辖。

1958年改称纸行街第七居委会。

1960年与第一、第二、第三居委会合并为光塔人民公社纸行管理区。

1961年复称纸行街第七居委会。

1999年纸行街并入诗书街。

2002年由祥龙里、牛头巷、惠福西居委会合并，改称三元巷社区居委会。

2013年改属光塔街，仍称现名，沿用至今。

三元巷社区附近有毛泽东同志主办农民运动讲习所旧址纪念馆、越秀公园、中国共产党第三次全国代表大会会址纪念馆、黄花岗七十二烈士陵园（黄花岗公园）、广州起义纪念馆、广州中山纪念堂等旅游景点，有广州牙雕、仁信双奶皮、药秘鱼头火锅、广州烧乳猪、龙虎斗、法式焗蜗牛等特产，有广州灰塑、五羊传说、广式莲蓉饼食制作技艺、敬修堂传统中药文化、采芝林传统中药文化、太虚拳等民俗文化。