地名由来：《宋书》载，南朝宋大明二年（458）“殷孝祖修两城于清水东，以防魏军南侵”。北齐天保元年（550）五月，高平县废，称两城寨，简称两城。

2014年7月，农业部认定两城镇为第四批全国一村一品示范村镇（两城大蒜）。

两城镇位于南四湖之一的独山湖畔，总面积130平方公里，其中水面11万亩，耕地4.3万亩。辖48个行政村、7.5万人。

两城因战国时期的匡城、矛城而得名，历史绵长，人杰地灵，文化灿烂。境内出土的属大汶口文化时期的南薄村西北堂台遗址、战国时代的姬家林遗址、汉墓群及汉画像石，证明自6000年前就有人类在这里繁衍生息、居住生活。秦时在两城置橐县，汉初改为高平县南朝宋时为高平郡治所。被誉为汉末建安“七子之冠冕”的著名文学家王桀、东汉著名的医学家王叔和、三国时“魏蜀吴争汉鼎”中的重要人物刘表、魏晋玄学的奠基人王弼以及张俭、仲长统、张湛等均生于兹、长于此。悠久的历史文化给两城留下了甚多名胜古迹，著名的伏羲陵、伏羲庙、圣母池泉、独山岛、承匡山（今凤凰山）、高平山（金九峪山）、桃花山等久著盛名。伏羲陵北依风景秀丽的凤凰山，南临碧波连天的独山湖。陵上伏羲庙飞檐凌空，柱础拙古，庙后有“六合泉”、“圣母池泉”，湖光山色相映，环境幽雅秀丽。

两城资源丰富，交通便利，境内山明水秀，物产丰富。湖内有鱼、虾、鳖、蟹、苇草、莲藕、菱、芡实等水生动物70余种，万亩荷花连片养护，实现可种植业优质高产高效和渔业、畜牧业的规模化、名优化。山上有8500亩连片森林，是山东省最大的纯侧柏林场。已探明砂石储量11亿立方，建有采石场124处，白灰厂一处，水泥厂一处。水陆交通便利，京杭大运河、白马河绕乡而过，省道济微公路穿乡而行，为经济建设提供了良好的发展环境。

两城人民坚持以经济为中心，扬山水自然优势，走强乡富民之路。培植壮大了渔、牧、农三大主导产业。建起了一条近30华里的水上名优水产品养殖带，河蟹、、乌鳢、彭泽鲫等名优水产品基地建设初具规模，养殖总面积15000多亩，水产品总时不量达到8000吨；以养鸭和珍稀皮毛动物、七彩山鸡饲养总量达到110万头（只），畜牧业产值突破了7000万元；农业产业结构调整迈出新步伐，以大蒜为重点的经济作物种植面积达2万多亩，粮经比例保持5：5，围绕大蒜加工，建立了七处蒜片加工厂，1处蒜油厂，新上了一座300吨的恒温保鲜库，确保了大蒜保值增值。山区甘果业发展初见成效，冬枣、石榴及花椒等已在山区落户。民营经济发展迅速，丰富的山、水、砾石、渔湖产品，优美的风景和众多的名胜古迹的优势得到充分发挥的。渔、牧、农产品加工、营销向深层次和规模化发展.。

微山伏羲庙

伏羲即太昊，死后葬于高平（今微山县两城刘庄村西）。背负峥嵘挺秀的凤凰山（亦称画卦山），怀抱碧波万顷的独山湖。陵后有六合泉、圣母泉等。湖光山色相映，环境幽雅秀丽。陵上为平面，建有伏曦圣祖庙，前

两城古墓群

两城古墓群位于微山县两城镇两城村北，年代为汉，类别为古墓葬。1985年4月17日，两城古墓群被公布为济宁市市级文物保护单位。

两城朝阳洞

两城朝阳洞位于两城镇，年代为清。为微山县文物保护单位。

观音堂遗址

观音堂遗址位于两城镇，年代为战国、汉。为微山县文物保护单位。

两城山寨遗址

两城山寨遗址位于两城镇刘庄村，年代为清。为济宁市市级文物保护单位。

房头北村城门

房头北村城门位于两城镇房头北村，年代为清。为济宁市市级文物保护单位。“城门”应为“寨门”，此处古寨门应是当年筑寨抵御土匪的遗存建筑。

历史沿革：

夏代，两城属仍国，商代，两城属任国。

西周，两城属茅园。

春秋时期，两城属郝国。

战国时期，两城属齐国的任国。

秦，两城属薛郡的方与县。

两汉属充州刺史部秦县，王莽更名高平县。

东汉，属充州刺史部山阳郡高平县。

三国魏，属充州山阳郡高平县，西晋，属充州高平国平县。

东晋，南朝宋属充州高平郡高平县。

隋，分属鲁郡的任城县，邹县，彭城郡的方与县。

唐，属河南道充州的任城县，方与县，邹县。

五代，分属任城县，邹县，鱼台县。

北宋，属京东西路济州的任城县，单州的鱼台县。

金代，属山东西路济州的任城县，单州的鱼台县。

元代，属中书省济宁路济州的任城鱼台县。

明代，属山东布阵使司充州府的济宁州，鱼台县，邹县。

清代，属山东省济宁路济州鱼台县，邹县。

中华民国北单阀政府时期，属山东济宁道的济宁县，邹县，鱼台县。

国民政府时期，属山东省的济宁县、邹县、鱼台县。

1953年8月，1958年12月，分别由凫山县和济宁县划归微山县。

1962年5月，马坡公社的两城、北薄管区与鲁桥公社的陈庄、东单管区合并，建立两城公社。

1984年4月，改为两城乡。

2010年5月，撤乡设两城镇。