地名由来：汉魏晋时期曾在盆地靠西南处倚一小山垒石砌建城堡，明初在城堡东北3千米处夯土筑一长方形土城，因此而得名。

2021年2月，石包城乡被命名为2020年度甘肃省卫生乡镇（街道）。

肃北蒙古族自治县辖乡。为全县绒山羊基地。1961年设石包城乡，1969年改公社，1983年复置乡。位于县境南山区北部，距县城148公里。面积6910平方公里，人口0.1万。蒙古族占63%。有公路通县城。辖石板墩、哈什哈尔、公岔、鹰嘴山、石包城5个村委会。地处榆林河源头。地势平坦，草原面积大。畜牧业以养羊、牛、骆驼为主。农业主产小麦、豌豆、马铃薯和胡麻。石包城遗址始建于汉晋，为边塞攻守兼优的城堡，叠石为城，城垣完整。境内七个驴岩画有很高的观赏和研究价值。

历史沿革：

汉时，为敦煌郡广至县管辖。

魏时，袭汉制。

晋时，归宜安县管辖。

隋时，隶属敦煌郡。

唐时，归瓜州常乐县管辖。

1951年，自治县成立后，设立乡人民政府。

1958年，撤销乡制，改为石包城大队。

1969年，改设为公社。

1985年，复设为石包城乡。

2005年，鱼儿红乡并入石包城乡。