地名由来：清源镇因境内泉源密布，清源沟流经其境而得名。

2023年8月，农业农村部、财政部发布首批国家农业产业强镇名单，清源镇（生猪）榜上有名。

2016年10月，清源镇被住房和城乡建设部认定为第一批中国特色小镇。

清源镇位于城东沙漠边缘，镇域面积168.8平方公里，其中耕地面积37719亩。辖15个行政村，即：新地、新东、清泉、发展、新西、王家新庄、羊庄、东槽、中沙墩、蔡家寨、宣家庄、周府庄、清源、曾家堡、刘广寨，下设114个村民小组，总人口23751人。镇政府驻蔡家寨村。2001年，完成农业总产值6423万元，财政收入129万元，乡镇企业总产值13550万元，农民人均纯收入2357元。有中小学17所，在校学生5175人；有卫生院4处。境内有省级文物频危野生动物繁育中心和沙漠公园、市沙产业开发中心、区治沙站等单位驻在镇区；皇台万亩葡萄基地、清源生态农业观光园区已初具规模。

制种业发展迅速，已形成产业优势。近年来，制种产业前景看好，镇上同区种子公司、农科院、瓜菜研究所等单位联系，引进西红柿、籽瓜、玉米、辣椒等制种项目，发展制种面积6000亩。苗木花卉等特色优势产业发展前景看好，形成以蔡家寨村为中心，向周围村组辐射发展的趋势。苗木品种由原来较单一的白杨、沙枣等品槐、刺槐等经济林苗木40多个品种及牡丹、芍药、丁香等10多个花卉品种，运销范围达新疆、内蒙、宁夏等省区。规模养殖稳步发展，建立了东槽规模养猪示范点，引进三元杂交瘦肉型猪进行繁育推广；永康仔猪育肥中心年出栏4000头，发展规模日趋扩大。全镇规模养殖户达2560户。

清源镇今后经济发展的目标是：大力发展高科技生态农业园区，建立以酿酒葡萄、蔬菜种植为主的产业化经营区，建好以蔡寨商贸一条街为主的商业长廊，着力培育二、三产业和饮食业为主的各类服务项目，努力建成集休闲、娱乐、餐饮、旅游为主的小城镇。

历史沿革：

西汉至十六国“五凉”时期，清源镇境域属武威郡姑臧县。

北魏至隋初，属武威郡林中县。

唐宋年间，复归姑臧县。

元时，属永昌路西凉州。

明清时期，先后归凉州卫和武威县。

民国元年（1912年）后，分属武威县白塔、大河乡。

1949年9月，属白塔、大河区。

1952年7月，属第十四区（清源）。

1956年1月，为清源乡。

1958年10月，由清源、清水、长城乡合并成立清源公社。

1962年，分设为清源、清水、长城公社。

1983年7月，为清源乡，同时设立新地乡。

1986年1月，清源、新地乡合并设立清源镇。