地名由来：因有东、西、南三座塔鼎立而得名，称三塔。为区别太和县三塔镇，1992年撤区并乡后更名为三塔集镇。

2022年2月，安徽省爱国卫生运动委员会命名三塔集镇为2021年度安徽省卫生乡镇（街道）。

2020年7月，三塔集镇入选第六届阜阳市文明乡镇。

2019年5月，三塔集镇被授予2018年度安徽省森林城镇称号。

2014年,阜阳行政区划调整：阜南三塔集镇划归颍州区管辖

三塔集镇距阜阳市区13公里，到阜阳飞机场仅9公里。京九铁路和南阳大道直穿境内，南北运河擦边而过，位置优越，交通便利，下辖36个村委会，371个自然村，人口6.6万人，土地6.3万亩，总面积79.6平方公里，为安徽省综合改革试点镇。

三塔集兴于明朝万历年间，因建有锁龙、栖凤、慈云三座宝塔而得名，这里曾出土文物——楚国货币“郢爰”，现被故宫博物馆收藏。地处淮北平原的三塔，资源丰富、平畴沃野、四季分明、物阜民丰。主要农作物有小麦、黄豆、棉花、玉米、芝麻、薯类，并盛产牛、羊、猪、鸡、鸭、鹅，其中三塔镇禽蛋市场闻名全国。

近几年，三塔镇本着“解放思想、抢抓机遇、求真务实、乘势快上”的发展理念，以“农业增产、企业增效、财政增收、社会和谐”为宗旨，采取“公司+基地+农户”模式，使农业与企业联姻，农户与商家联手，大力发展种养业，广泛招引外商外资。至今，已有二十多位客商来我镇投资兴业，先后涌现出阜南宝华木业有限公司、三塔自来水厂、三塔飞达挂面厂、恒信家具有限公司、腾达电动车厂、乐华瓜篓示范基地等20多家骨干企业。这些企业同时又构建了三塔板材、禽蛋、粮油交易、三大专业市场。2004年工农业总产值达1.9亿元，2005年可望实现2.05亿元。

目前，我镇有3千门程控电话和电信宽带与全国联网、农行、邮政等金融机构可办理全国汇兑业务，京九铁路“三塔站”距镇府仅2公里，基础设施良好，城镇框架宏大，工业园区完善，投资环境大大改善。三塔经济繁荣，政通人和、民风纯朴、教育文化事业蓬勃发展，社会治安多次被县评为先进单位，勤劳、善良的三塔人民竭诚欢迎各方有识之士前来兴业办厂、共同实现“你发财、我发展”的目标，共创三塔美好未来。

历史沿革：

放前属阜阳县大田区；解放后划入阜南县许堂区；1958年9月成立公社；1984年3月社改乡；1992年4月撤区并乡，设三塔集镇；2015年区划调整划归颍州区管辖。