地名由来：藏语，意为两山之意可通行的狭窄地方。因寨建于山间阶地，有上中下三排，该地居中，故名。

2022年1月，三垭镇被评定为2021年度甘孜州乡村振兴先进县（镇）。

2019年，撤销俄尔彝族乡、三垭彝族乡，设立三垭镇，以原俄尔彝族乡和原三垭彝族乡所属行政区域为三垭镇的行政区域，三垭镇人民政府驻龙塘子村4组32号。

历史沿革：

2019年12月23日，四川省人民政府关于同意甘孜州调整康定市等6个县（市）部分乡镇行政区划的批复（川府民政〔2019〕25号）：撤销俄尔彝族乡、三垭彝族乡，设立三垭镇，以原俄尔彝族乡和原三垭彝族乡所属行政区域为三垭镇的行政区域，三垭镇人民政府驻龙塘子村4组32号。