地名由来：原磨山村为春秋时期建村，因聚落位于磨山脚下而得名。后分为磨山东村，磨山西村。镇驻地原为磨山东村，镇以村命名。

2022年12月，山东省农业农村厅确定磨山镇为2022年山东省级农业产业强镇。

磨山镇位于兰陵县城东部10公里处，总面积82平方公里，耕地面积7.8万亩，辖21个行政村（社区），42个自然村，总人口8.1万人。其中回民村3个，回族人口5560人，是回汉民聚居的乡镇，也是兰陵县回族居住人口最集中的乡镇。下设8个党总支，52个党支部，其中农村党支部42个，党员1547人，其中农村党员1281人。磨山镇地处平原，地势北高南低，兰郯、沂磨、兰邳公路和县城东二环道路从境内穿过，西部属于县城东城新区，地理位置优越，交通便利。是典型的农业大镇，农作物以小麦、玉米为主，经济作物以大蒜、露天蔬菜为主，为“苍山大蒜”主产区，优质大蒜种植面积达6万亩。工业以皮革、板材、农产品加工为主。近年来，随着兰陵县东城新区建设的实施，金融、商贸、物流等服务业得到较快发展。2018年，全镇完成镇级财税收入4940万元，同比增长10.07%，农民人均可支配收入达21300元，增加1780元。

历史沿革：

抗日战争前属郯城县四区。

1940年，属临沂县抗日民主政府。

1945年，属赵镈县。

1947年，属苍山县。

1958年初，称磨山乡，秋，称磨山人民公社。

1984年4月，改磨山镇，并沿用至今。