地名由来：“巧马”系布依语，意为马的头部，因其境内地形如马的头部而得名。

2020年7月，全国爱卫会命名巧马镇为2017-2019周期国家卫生乡镇（县城）。

巧马镇位于册亨县西南部，地处黔桂两省交界的南盘江畔三县（册亨、安龙、隆林）结合部，南昆铁路横穿境内16多公里，并在镇政府所在地纳贤建有县级客货运火车站，盘百公路过镇南部9.7公里，建有南盘江大桥横跨南盘江通往广西隆林，公路经县城到镇通往盘(县)百(色)公路。镇政府驻纳贤。东与丫他镇接壤，西与安龙县坡脚乡毗邻，南与广西隆林尾乐乡隔江相望，北倚冗渡镇，东西长18多公里，南北宽18多公里，周长67多公里，总面积243多平方公里。镇政府所在地高程530米，最高海拔1420米，最低海拔383米。于1991年12月由原巧马、板坝、者告、孔屯乡合并成立巧马镇。镇境内居民有汉、布依、苗、壮、仡佬等5个民族，1998年底有人口1.16万人。

全镇共辖13个行政村，67个村民组。镇境内有5所学校。镇境内有耕地27105亩。土壤肥沃，适宜多种农作物、经济作物和林木，主产水稻、玉米、小麦、甘蔗、早熟蔬菜、油桐、麻竹、云南松、马尾松、椿树、杜仲、水蜜桃、李子等经济林木和经济作物。".

历史沿革：

清属册亨州同百弼甲者浩亭。

民国时期属册亨县四区巧马联保。

1951年，属二区板坝乡。

1961年，设立巧马公社。

1984年，改设巧马乡。

1992年，设立巧马镇。