地名由来：“万祥”系旧时店铺名称。故名万祥镇。
2022年10月，2022年淘宝镇名单发布，万祥镇上榜。
2021年10月，南京大学空间规划研究中心、阿里研究院联合发布2021年淘宝镇名单，万祥镇榜上有名。
2020年9月，阿里研究院公布2020年淘宝镇，万祥镇榜上有名。
万祥镇位于浦东新区的东南部，属于临港地区，与上海洋山深水港及上海浦东国际机场相毗邻，距深水港15公里，距航空港18公里。区位优势突出，交通便捷，远东大道、白玉兰大道横贯万祥境内。全镇总面积为23.4平方公里，耕地面积1200公顷，辖7个行政村、2个居委会。总人口21800余人。万祥的经济以工业为支柱，已拥有一批科技较先进的、市场占有率较高的骨干企业；万祥的农副业生产已形成了高产、优质、高效的农业生产新格局，其中西甜瓜、水产品等农副产品久负盛名。
大事记
1947年11月12日，浦东人民护丁总队袭击驻本县万祥镇的-的62师的1个连，缴获各类019支，子弹数千发。历史沿革：
万祥成陆于清代中叶，初为盐场。
1949年5月南汇解放，南汇县人民政府下设6个办事处，万祥地属第六乡镇联合办事区管辖。
1955年9月南汇县撤区并乡，万祥地区归金陵、新港、书院3乡。
1958年3月南汇县划归上海市，9月实行政社合一，万祥地区、书院地区合并成立书院人民公社。
1959年6月万祥地区从书院人民公社中析出，独立建置成立万祥人民公社，驻万祥路47号。
至1962年下辖15个生产大队。
1984年4月实施政社分设，建立万祥乡，下辖15个行政村。
1991年1月20日万祥集镇所属区域建立居民委员会。
1995年7月13日撤销万祥乡建制，建立万祥镇，下辖15个行政村（150个村民组），1个居民委员会（4个居民小组）。
2001年1月撤销南汇县设立南汇区，万祥镇属南汇区。
2002年3月至5月调整村级区划。
2009年4月撤销南汇区，并入浦东新区，隶浦东新区。