地名由来：因辖境有花石崖得名。

2019年10月，2019年度全国综合实力千强镇榜单公布，花石崖镇位列第336名。

花石崖镇位于神木县城南110公里处，乔万路穿镇而过，交通便利。全镇总土地面积226平方公里，辖28个行政村，73个自然村，有常住人口3841户，16143人，外出人口有11996人，占总人口的74%。全镇有党员689名，其中农村党员616名。有中学一所，小学5所，学生1260人，农民人均纯收入达1680元。

全镇有耕地6.5万亩，盛产薯、枣、羊、豆等产品。西部大开发实施以来，镇党委、政府提出了“发展草畜产业，建设经济强镇”的奋斗目标，积极调整产业结构，加快畜品种改良步伐。历年累计退耕还林20473亩，退耕还草37642亩，养奶牛43头，肉牛2300多头，羊子存栏1万多只。累计投资150多万元建成一街两市的小城镇格局，极大地活跃了市场，有力的促进了全镇经济的发展。今年，全镇上下齐心协力，积极利用中央对农业的补贴政策和我镇草畜优势，鼓励农民种植地膜绿豆、种子洋芋、地膜玉米，增加农业收入。大力发展畜牧业，利用现有的饲草资源，力争到年低使农民人均纯收入达到2000元，人均增长320元。

在经济发展的同时，党建、精神文明建设也取得了较好的成绩。按照“规模并大、实力并强、班子并优、关系并融”的目的，经过近3提的行政村合并工作，全镇行政村由73个减少为28个。今年镇党委提出“立足一类支部出经验、出成果，二类支部巩固、提高上台阶，消灭三类支部或无支部村，使一类支部达到95%”的奋斗目标，通过行政村合并，来优化农村基层班子结构，全镇现有支部31个，其中农村支部28个，机关支部3个，一类支部达到91%。积极创建安全村镇，全镇遵纪守法户有2850户，十星级文明户2540户，社会治安明显好转。全镇95%的人口均参加了农村合作合疗，解决了农民看病难、因看病返贫的问题。

历史沿革：

民国时期为联保。

民国二十六年（1937年）至民国三十四年（1945年），为神木第六区。

1949年10月后，为第三区，辖6个乡。

1958年，成立花石崖公社，辖35个生产大队。

1984年，改设为乡。

1997年，改设为镇。