地名由来：相传木耳乡一带古时森林覆盖，广产天然木耳，故名。

2019年1月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名木耳乡为2018年度甘肃省卫生乡镇（街道）。

木耳乡位于宕昌县北部，总面积6284平方公里，海拔高2100—3200米，无霜期170天。全乡共10个行政村，48个村民小组，1693户、7756人。2000年农民人均纯收入640元，人均占有粮310公斤，主要农作物有洋芋、小麦、青裸、大豆等，主产药材有当归、黄芪、柴胡、甘草等。有较丰富的草场资源，适宜发展畜牧业，有丰富的矿泉水资源急待开发利用，欢迎各界人士前来投资开发。

历史沿革：

1949年以前，属岷县理川镇。

1950年，设木耳乡。

1961年，木耳乡改为木耳公社。

1983年10月，木耳公社改为木耳乡。