地名由来：巫峡镇因地处巫峡口而得名。
2011年区划调整后，巫峡镇辖原龙井乡绿水、青山、春泉、龙山、文峰、桂花、七星、新路、白泉、白水、陈家、红庙、石里村和原巫峡镇柳树、西坪、平安、东岗、跳石村及南陵社区，共18个村、1个社区，面积172.5平方千米，镇政府临时驻地为聚鹤街2号（原龙井乡政府驻地）。原巫峡镇集仙、飞凤、松峦、上升、朝云、登龙、神女、起云、圣泉、翠屏、净坛11个社区划归新设立的高唐街道管辖。原巫峡镇聚鹤社区、龙江村和原龙井乡的龙水、梨早村划归新设立的龙门街道管辖。
南陵古道
南陵古道位于巫山县巫峡镇南陵居委会至建平乡春晓村，时代为清。2019年，南陵古道被重庆市人民政府公布为第三批重庆市文物保护单位。
历史沿革：
明正德二年（1507年），在境内修筑石城。
民国二十八年（1939年），县城命名为中和镇。
民国三十四年（1945年），以巫山十二峰命名十二条街道名称。
1949年12月2日，中和镇成立，隶属中和区。
1950年3月，原中和镇划为中和乡和城关镇。
1951年6月18日，撤一区的中和镇，改为中和乡，并增设城关镇。
1981年3月，城关镇更名为巫峡镇。
1987年7月9日，撤销巫山县秀峰乡，并入巫峡镇，设置秀峰办事处。
1989年3月30日，撤销巫峡镇秀峰办事处。