地名由来：因辖区内秦祁河而得名，。相传此地曾为秦王朝集结兵力之要地，故名秦集，后演变为秦祁。

秦祁乡地处甘肃省渭源县北部，西北与临洮和定西两县接壤，距渭源县城40公里，距定临公路19.8公里，定渭公路15公里。境内地势西北高，东南低，山多沟深，东西长18公里，南北宽17公里，地域面积115.95平方公里,最高海拔(岗家岔山顶)2585米，年平均气温5℃，年降水量420毫米,降水量分布不均匀,主要集中在秋季,土壤瘠薄，植被稀少，林木面积仅为14228亩，水土流失严重，水质咸苦，境内有秦祁河穿过，秦祁乡以此河而得名。

全乡有11个行政村，64个村民小组，总人口10586人，耕地面积40600亩，人均耕地面积４亩，多数是山旱地。粮食作物主要种植小麦、小豆、洋芋、糜谷、莜麦、扁豆、燕麦等。经济作物主要是胡麻、药材(党参、黄芪、柴胡)等。此外有黄芩、青艽、柴胡、甘草等野生中药材。畜牧业以山羊、绵羊为主，也是当地农民收入的重要来源。境内还有白马峡，大理石藏量相当丰富，但由于地理条件的限制，目前尚未开发。

近年来，全乡走“科技抗旱，结构抗旱”发展之路，药材、洋芋种植面积不断扩大，“梯田＋水窖＋地膜玉米”的模式得到了发展。洋芋、豆类、药材成为农民收入的主要产业。98年全乡基本实现整体脱贫。通过“压夏增秋，压粮增经”，种植结构更趋合理，逐步改变了传统农业种植结构。秦连(临洮连儿湾)公路、秦漫(&127;临洮漫洼)公路已全部打通，乡村、村社道路全部修通，基本实现全乡通车的目标，全乡有农用三轮车440多辆，客车2辆。有“四、七、十”集市贸易市场，个体户70多户，有电话23部，其中芨芨沟、中坪、西坪三村开通了无线电话。广播电视转播站1个，村村通工程３处，广播电视覆盖率100％。户均有两眼以上的“121”水窖，基本解决了群众吃水难的问题。全乡有完全制中学一所，小学17所，教职工101人，在校学生2100多人。

历史沿革：

1949年9月以前，属渭北镇。

1949年10月，属第五区。

1958年12月撤销渭源县时，并入北寨公社。

1962年12月恢复渭源县后，设秦祁公社。

1983年7月，改秦祁乡。