地名由来：因苗姓兴集而得名苗集。

2023年8月，安徽省爱国卫生运动委员会命名苗集镇为2022年度安徽省卫生城镇。

2021年9月，苗集镇被认定为第二批全国乡村治理示范乡镇。

2020年7月，苗集镇入选第六届阜阳市文明乡镇。

2020年4月，苗集镇上榜第五届安徽省文明村镇名录。

苗集镇位于阜南县城东10公里处，,1992年编为建制镇，系省道S328必经之路，南靠谷河、北靠淘子河，是一个地势优越,早水田间作农业开发基地。全镇共33个行政村，166个自然庄,人口5500千人，耕地面积63259亩,海拔高程22-33米，属温暖带，半湿润季风气温，光照充足，年平均降雨最800-1000mL无霜期200-220天，四季分明，适宜各种农作物的开发和生长。该镇除分季农作物的种植以外，还有很多的经济收入来源，如：大棚辣椒示范基地、沈青箩卜、高产玉米。特别是农业的项目开发，如“金奉19”，杂交水稻制种基地，该基地“金奉19”是以80－4A为母体，以MIRI9为父体杂交育成，2003年1月通过安徽省农作品物品审定委员会审定。制种基地种植技术操作和科技都由省农科院全程服务。大力发展乡镇企业，利用上级招商引资有关优惠政策,他们先后引进了由广东老板投资60万元的珠秀厂，台湾老板投资180万元的双龙鞋业有限公司，产品都出口销售广东、深圳和港澳地区，还有河北、河南的面粉加工老板。河南老板利用我们的有利资源，生产的板材，销往上海、浙江、江苏等地，给当地广大群众带上发展经济致富奔小康之路。

历史沿革：

解放前设阜阳县王化区张古乡。

解放后苗集区设此。

1958年成立苗集公社。

1983年社改乡，成立苗集乡。

1992年撤区并乡时苗集乡、马塘乡、杏集乡与张古乡合并为苗集镇。