地名由来：此地人口较为集中，过往客商亦多，遂建房设店，兴场开市，故名。

2019年12月，店子镇入选2019年四川省卫生乡镇（街道）名单。

剑阁县辖镇。1953年设店子乡，1958年改公社，1984年复置乡。位于县境东部，距县府30公里。面积65.7平方公里，人口1.2万。剑阁至圈龙公路过境。辖大河、天台、盘龙、联盟、元丰、西至、龙水、尖山、登高、石岩10个村委会，农业主产水稻、玉米、小麦、油菜子，兼产棉花。

历史沿革：

南朝齐时白水县。

北朝西魏废帝三年（前554），更名永归县，治地现大河村八组。

1935年4月，设店子乡，同年4月设店子区苏维埃；1950年1月，设店子乡，属白龙区公署；1958年9月更名为店子公社；1966年11月更名为永兴公社；1967年恢复原名店子公社。

1984年更名为店子乡；2020年改乡为店子镇，名称沿用至今。