地名由来：据该村《朱氏族谱》记载：春秋战国时期属廪邱，名为飞云驿。后晋开运元年（944），滑州河决，飞云驿四面环水，方园数里，一片汪洋，飞云驿由此改名水堡。宋、元先后改名义东堡、水堡寨，清为水堡镇，后简称水堡。

郓城县辖乡。1958年建水堡公社，1961年改玉皇庙公社，1979年重建水堡公社，1984年改乡。位于县城西，距县城20公里。面积36.3平方公里，人口2.2万。李(集)黄(安)公路和金堤公路交叉穿境而过。辖水堡、西马楼、杜楼、崔庄、顺河楼、广胜集、王庄、赵垓、新复街、孙河涯、肖垓、肖马庄、西陈楼、殷庙、魏坝、朱河湾、阎堂、后肖屯、西北王楼、张庄、赵东南、赵西南、赵楼北、赵新、华庄、李庄、丁楼27个村委会。农业以种养业为主，所产青猾皮畅销国内外。据史书载，水堡村是北宋农民起义领袖宋江的故里。

历史沿革：

1952年全县分十七区时为十区和十一区分管。

1958年初撤区并34乡，分属水堡、陈坡两乡，同年秋成立水堡公社。

1961年，水堡公社改为玉皇庙公社。

1979年从陈坡公社划出王楼、新王楼、赵庄、朱河湾、闫堂、后屯、魏坝、赵楼、赵新、黄洼、张庄、李庄、华庄、崔庄、顺河楼15个自然村，玉皇庙公社划出水堡、新水堡、新复街、前杜楼、后杜楼、丁楼、西马楼、曹楼、广胜集、新刘集、前王庄、后王庄、赵垓、孔河涯、肖垓、陈楼、殷庙、肖马庄18个自然村，共33个自然村组建水堡公社。

1984年改社建乡，改建为水堡乡。