地名由来：原称石门坑，因屡次遭火灾，改为水门。有以水克火之意，又因村民多数为畲族。故名。

霞浦县辖乡。1958年设水门公社，1984年改水门畲族乡。位于县境东北部，距县城11.8公里。面积149.6平方公里，人口2.3万。省道沙吕段过境。辖水门、青岙、墩后、茶岗、高盘、芦阳、大洋、武坪、里洋、半岭、湖里、桥头、承天、八斗丘、水井头、小竹湾、长湖、上洋、玉山、百笕、大浿、大平、七斗岔23个村委会。农业主产水稻、薯类，兼产茶叶、杉木、杂木。

历史沿革：

宋代，境域分属劝儒乡擢秀里、柘阳里。

元至清光绪年间，境域分属二都、三都、四都、二十八都。

1936年，隶属第二区。

1958年设水门公社。

1961年5月，水门公社改为水门区。

1966年10月，水门区改为水门公社。

1984年水门公社改为水门乡。

1985年水门乡改为水门畲族乡。