地名由来：木卓镇原名彝语杓佐，后演变成木卓，因镇人民政府驻地木卓而得名。

2021年3月，木卓镇入选2020年云南省卫生乡镇名单。

木卓镇位于县境西北部，全镇总面积87平方千米，辖7个行政村（社区）、132个村民小组（居民小组），耕地总面积1793公顷，农作物种植面积5379.1公顷，其中，粮食作物4363.1公顷，粮食产量13588吨。年内大牲畜出栏4175头，年末存栏8056头；肥猪出栏36254头，生猪存栏31591头；羊出栏472只，存栏666只；家禽出栏148609只,存栏122661只。各行政村均通公路、通电、通自来水。广播电视覆盖率为82%。

历史沿革：

清朝，属上东效和里（雨河）。

民国二十三年（1934年），属五区（雨河）、九区（芒部）总份辖地。

民国二十九年（1940年），属雨河乡。

1950年，属芒部区。

1953年，属雨河区。

1988年，从原雨河区分出设木卓乡。

2012年8月，撤乡设镇。