地名由来：因谷地宽平，土壤丰腴，昔西北、东南两处山谷遍种蔬菜，在泗礁及附近各岛山岙中产蔬菜最多，故名。

2023年8月，菜园镇被评定为舟山市儿童友好乡镇（街道）。

2014年7月，菜园镇被国家住房城乡建设部等七部委确定为全国重点镇。

2012年12月，环境保护部授予菜园镇2010—2011年度国家级生态乡镇称号。

菜园镇位于嵊泗县泗礁岛的中西段，是0嵊泗县委、嵊泗县人民政府机关驻地，是全县的政治、经济、交通、文化中心，菜园镇东与五龙乡接壤，南至著名的矿石中转基地－－马迹山港。东北是闻名的基湖大沙滩，东南为南长涂大沙滩。全镇陆地总面积28.18平方公里。

2001年2月15日，嵊泗县菜园、马关、金平、绿华四个乡镇建制撤销，合并成新的菜园镇。目前全镇设东海、沙河、海滨、菜圃4个社区居委会，马关、金平、青沙、金沙、绿华5个渔农村新社区和基湖、高场湾、石柱、关岙、小关岙、马迹、青沙、金鸡岙、黄泥坎、-头、大鱼岙、绿华共12个行政村，全镇总人口34248人。

菜园地区是全镇的政治、经济、文化中心，沙河路、海滨路、东海路贯穿整个城区，成为主要街道、商店和娱乐场所集中，新建的商品楼、居民楼错落有致，己扩展到山腰山岗，东南峰顶矗立着国家级科研项目——18千瓦和40千瓦两座风力发电组，东南尽处是小菜园，那里有客货运码头，随着小菜园防浪堤工程的峻工，每天都有一些大小船只云集于此，菜园地区的基湖村，北面有一个大沙滩，1985年开辟了海滨浴场，有“南方北戴河”之称，是嵊泗县著名的风景旅游点。

白节山灯塔

白节山灯塔位于嵊泗县菜园镇，年代为1883年。白节山灯塔位于舟山市嵊泗县境内的白节山上。该灯塔始建于1883年，现塔为1946年重建。灯质：互闪红、白光60秒射程：22海里铸铁圆锥体，钢板内

历史沿革：

元大德《昌国州图志》卷二载为“泗头岙”。

明万历《两浙海防类考续编》卷一载为“梳头（岙）”。

清康熙《定海县志•防海记说》：“苏窦有大澳，然亦不利东南。”清乾隆《祟明县志》卷一载为“梭头（岙）”。

以镇区东北侧有形如梭尖的岬角而得名。

泗头、梳头、苏窦均为梭头谐音异写。

泗礁山岛的曾用名梳头山、苏窦山，即以此派生得名。

清光绪年间开始出现“菜园岙”名称。

1918年1：5万地形图《马迹山》载为“菜园村”。

1924年《崇明县志》卷二载为“大小菜园（岙）”。

1934年3月置菜园镇，属崇明县第五区。

以驻地得名。

1949年属嵊泗县。

1950年7月基湖村划入。

1953年12月分设基湖乡。

1956年4月基湖乡并入。

1958年改为菜园生产大队。

1962年复设镇。

1992年6月青沙乡并入。

2001年1月，马关镇和金平、绿华2乡并入。