地名由来：该地乡民自称为西藏后藏人的后裔，藏语称“藏巴哇”。

2023年3月，藏巴哇镇被授予甘肃省第十六批省级文明村镇称号。

2023年2月，甘肃省爱国卫生运动委员会命名藏巴哇镇为2022年度甘肃省卫生乡镇（街道）。

位于卓尼县境东北端，乡政府驻新堡村。

辖地北接渭源县；东连漳县金钟乡；西以洮河与临潭县羊沙乡为界；南与洮砚乡、柏林乡接壤。全乡总面积232.1l平方公里。平均海拔2300米。现辖6个村委会，20个村民小组，有农业人口968户4595人。该乡以农业为主，农作物以小麦、大豆为主，并种植当归、油料及栽培各类经济作物。气候温暖，四季分明，无霜期长。

历史沿革：

1949年，前属会川赵土司卓尼杨土司、临潭昝土司分管。

1953年，划归卓尼县设新堡区。

1958年，临卓合并后，改为新洮公社。

1963年，改新堡公社。

1982年，改为新堡乡。

2006年，与柏林乡合并，建卓尼县藏巴哇乡。

2017年04月，撤销藏巴哇乡，设立藏巴哇镇。