地名由来：马庙镇历史悠久，人杰地灵。据传，唐代马姓在此建村，修有庙宇，因此得名马庙。另据清同治年间《金乡县志》记载明洪武年间马姓氏族人修建“马家庙”。

2023年8月，农业农村部、财政部发布首批国家农业产业强镇名单，马庙镇（大蒜)）榜上有名。

2023年3月，马庙镇被认定为山东省首批绿色能源发展标杆乡镇。

2023年3月，农业农村部推介马庙镇为2022年全国乡村特色产业产值超十亿元镇（大蒜）。

2021年12月，马庙镇被认定为第二批山东省乡村振兴示范乡（镇、街）。

2021年12月，山东省农业农村厅认定马庙镇为2021年山东省级农业产业强镇。

2021年10月，农业农村部遴选推介马庙镇为2021年全国乡村特色产业十亿元镇。

2021年10月，农业农村部认定马庙镇为第十一批全国一村一品示范村镇（大蒜）。

2020年5月，马庙镇被确定为2020年农业产业强镇建设名单。

马庙镇地处山东金乡县西半部，距金乡县城11公里，北临羊山镇、东临金乡经济开发区，南邻鸡黍镇，东临金乡经济开发开发区，南邻鸡黍镇，西邻成武县大田集镇。全镇面积97.11平方公里，耕地10万亩，人口5.6万，家庭户1.4万。辖67个行政村，109个自然村。马庙镇交通便利，346省道东风公路穿境而过，辖区内公路纵横，实现了村村通公路，村村通电，村村通有线电视，村村通程控电话和无线通讯。

行政区划变更及历史沿革：马庙镇历史悠久，人杰地灵。据传，唐代马姓在此建村，修有庙宇，因此得名马庙。远在新石器时代先民在此繁衍生息。夏属缗国，舜子季禧的封地，是当时山东的政治文化中心——曲阜走向中原地区的咽喉，是东夷挺进中原参加部族大融合的必经之地，为华夏族及华夏文化的形成做出卓越的贡献。在这块热土上，培育了西汉梁王彭越，三国名将满宠等历史名人。1930年马庙正式形成建制——马庙区，1940年属金西办事处，1958年8月为马庙人民公社，1984年建乡，1999年改镇至今。马庙镇人民有光荣的革命斗争传统，鲁西第一个农村党支部——翟庄党支部就是马庙乡翟庄村人翟子超与1936年12月创建的；为了新中国的诞生，马庙的志士仁人前仆后继，为革命牺牲的烈士达140余人，在马庙生活战斗过的同志成为地市级以上领导干部的就有秦和珍、-等30余人。解放后，马庙更是人才济济，涌现出受毛主席、-多次接见的女民兵英雄张秀兰和全国计划生育标兵李秀兰。

自然地理资源：马庙镇属于暖温带季风性大陆气候，四季分明，降水丰沛，气候温和，物产富饶，光照充足，雨水适量。夏季降水集中，雨热同季，年平均降水量631.2毫米。年最高温度38.5摄氏度，平均气温为26.1℃，最高时可达26.9℃；冬季寒冷干燥，最冷的月份平均气温为0.4—1.9℃；全年平均气温为13.3—14.1℃。

农业生产方面：马庙地势平坦，土壤肥沃，适宜多种农作物的生长，盛产玉米、棉花、大豆、小豆、谷子等杂粮。小麦种植面积8335亩，单产466公斤；大豆种植面积1970亩，单产220公斤，总产12031775公斤，年总产值2775万元。

主要经济作物有棉花、大蒜、花生、芝麻等，棉花年总产值1314万元，大蒜年总产值22675万元。马庙是金乡白皮大蒜的发源地，是金乡有机大蒜的主产地。马庙大蒜具有2000多年的历史，早在东汉初年，马庙就有种植大蒜的记载，经过长期的培育发展，加上这里属于温带地区，风和日丽，四季分明，土质肥沃等优越自然条件，马庙白皮大蒜这个传统的特色产品在品质上得到不断地提高，现已形成具有马庙独特风格和优质品质的马庙白皮大蒜产业，所产大蒜个大、皮白、辣味适中、营养丰富，经许多国际研究机构证实，白皮大蒜中具有防癌和抑制肿瘤作用的二烯丙级、二硫化物，三硫化物，等主要药物成分，高出一般大蒜的几倍，甚至几十倍，被称为最好的抗生素食品。马庙的白皮大蒜成为马庙的特色支柱产业，创下了“九个中华之最”。92年在首届中国农业博览会上，白皮大蒜荣获中国白皮大蒜类唯一最高奖——银质奖，96年1月被国家评定为中国名牌产品，3月金乡被正式命名为“中国大蒜之乡”，10月获得A级绿色食品证书。目前，马庙镇白皮大蒜已出口日、俄美等70多个国家和地区。马庙是全国盛名的金谷之乡。金谷是马庙镇的著名特产，据《金乡县志》记载，金谷又名齐头占金谷，仅产于金乡县马庙镇的大程楼村北部马坡，被称为中国四大名米之一。金谷米色金黄，性粘味香，米质优异，营养丰富，据中国四大名米之首。金谷小米稀饭，闻之清香，食之甘美，具有热补，润肠功能，系滋补佳品，清康熙年间被列为贡品。建国十年大庆之际，周总理曾用此米招中外宾客。1996年马庙镇被国家农业部命名为“中国金谷之乡”。2010年，“马庙金谷”获国家农产品地理标志认证，这是继金乡白皮大蒜之后的第二个农产品的地理标志认证，也是济宁市2010年唯一获得地理标志的农产品，为马庙金谷的品牌化和产业提升提供了有力支撑。2011年上半年镇金谷协会在大程楼、程李庄等基地核心区建立金谷基地，现已发展面积2100亩。

该镇积极发展林业，依托白洼林场这一得天独厚的条件，林业年总产值达330万元，渔业年总产值达130万元。

工业方面：马庙的工业经济虽有一定的规模和基础，但总量偏小、门类不全、结构单一，全镇各类企业近100家，99%以上是农产品冷藏加工贸易企业，机械加工、服装制造，造纸制浆等其他门的工业企业屈指可数。但就农贸企业来看，近几年依赖丰富的大蒜资源，大蒜加工业有长足的发展，但布局零散、管理粗放、技术落后、效益低、抗风险能力差，没有真正走出出售原材料和低端初级产品的尴尬境地。单体不够大，群体不够强、行业优势还不够明显，尤其缺乏龙头型、带头型、能支持镇域经济发展的大企业。这种局面不改变，工业经济不可能实现质的突破。该镇将依托宏泰、红宇、达瑞、鲁腾、鑫偌、大成等骨干企业，打造大蒜产业航空母舰和产业集群。着力扩大清洁造纸、棉纺加工、棉纺服装、机械制造、轻工食品等产业市场，加大对相无科技、程前棉纺、富星棉业、顺源棉业、达瑞制衣、恒盛食品、工程机械配件公司和益友化工公司的扶持力度，鼓励它们挂大靠强，拿出优势资产对外合作。力争在较短时间内培育出2—3个有支撑力的工业企业。被农业部指定为“全国鲜活农产品中心批发市场”的国际大蒜商贸城，横穿马庙东西7.5公里。全镇共有三处大型农贸批发市场，现已成为全镇人民生产、金融、文化、娱乐中心，为境内的产品流通提供了有利条件。该镇工业主营业务收入达78645万元，工业利润总额4966万元。在工业经济发展上的思路是立足现有优势，做大做强大蒜产业，培植新兴产业，优化工业经济结构，把马庙打造成以农产品加工业为主兼顾其它门类的工业强镇。

文教卫生旅游方面：马庙镇有重视教育的优良传统，教育发达，人口文化素质较高。抗战时期闻名湖西的抗日小学就在曹坊村，0党员秦和珍，也在邵庄一带组织了4处小学。马庙镇武训式的人物程建渊，个人捐资助学大程楼村创办了金乡县第一处国办农村中学。目前，马庙普及了九年义务教育，每年都向国家输送大批的人才。

该镇现有中学一处，学区4个，分别是东部学区，南部学区，西部学区及中部学区。现有13所小学，幼儿园21所，入学率达100%。在校学生总人数3680人，教职工296人，其中中学在校生1100人，小学在校生2580人，中学教师106人，小学教师190人。

该镇有中心卫生院一所，卫生室30个，有医护人员55名，床位50个，参加新农合人数49651人，占总人口的百分之94.48%。

地理实体：马庙镇有大小河流5条，主要有新万福河、金城河、小白河、金马河、新西沟等。该镇现有大型桥梁6座，小型桥梁15座。6座大型桥梁分别位于付庄、石门、刘沙沃、洪庙、咸古店、湘子庙村。

翟庄党支部旧址

翟庄党支部旧址位于金乡县马庙镇，年代为1936年。2015年6月23日，翟庄党支部旧址被山东省人民政府公布为山东省第五批省级文物保护单位。

杨官庄遗址

杨官庄遗址位于金乡县马庙镇，年代为商、周、汉、元、明、清。2015年6月23日，杨官庄遗址被山东省人民政府公布为山东省第五批省级文物保护单位。

历史沿革：

1930年马庙正式形成建制——马庙区，1940年前马庙属羊山镇管辖。

1940年属八路军金西办事处，1958年8月为邵庄乡马庙人民公社同年成立红旗公社，1959年改名马庙公社。

1984年建乡，1999年改镇至今。