行政隶属清时属诏安县五都三图康罗保南山村；民国时属东山县中兴镇南港保（南山和西港村合）；建国后属三区南湖乡（与下湖、岭下合）；1951年属樟塘公社南湖乡；1959年属康美公社南湖大队；1961年拆出独立成樟塘公社南山大队；1984年属樟塘乡南山村；1993年属樟塘镇南山村。

面积人口全村面积1.1平方公里，耕地面积377亩，山林面积98亩。300户，人口1164人，6个村民小组，党员42人（正式党员41人，预备党员1人）。目前，随着县城东扩，该村大量土地已被征用，剩余土地不足200亩，全村已失地的农民达到700多人,约占全村人口的三分之二。

位置交通南山村位于东山岛中心地带，现已和西埔城区连在一起，村口就是县主干公路东西一路通村前，东西二路贯通村后，村水泥路从村头至村尾。

劳力资源全村青壮年劳动力736人，从事种菜、建筑装修、物业管理、经商收入。

经济社会村财主要靠土地开发收入，同时发展绿色蔬菜基地65亩，引进乐安和南达两个工业项目，开发兴建南山村部综合大楼，海魁、烟草、龙生、县电大等企业在此落户，呈现一派兴旺发达、蒸蒸日上的繁荣景象。

基础设施教育方面，文昌学村项目正在紧锣密鼓的进行。文化方面，拥有农家书屋1间、篮球场1个；卫生保障方面，设有村级卫生所1所；民生保障方面，自来水户户通，安装路灯30支，村内建主干公路2条。

南山村与南埔村、古港村、前马村、湖尾村、后马村、下湖村、港西村、樟塘村相邻。

南山村附近有东山风动石景区、漳州马銮湾、漳州东山岛、东山关帝庙、东山县博物馆、澳角村等旅游景点，有东山鲍鱼、东山芦笋、东山亲营紫菜、墨鱼干、水仙花、当归鸭面线等特产，有东山歌册、东山关帝信俗、铁枝木偶戏(东山县）、东山海船钉造技术、东山海柳雕技艺、东山金木雕技艺等民俗文化。