地名由来：明正统年间，有一道人为修建确山金顶寺，来此地化缘，共化得捐款万两黄金，此地又是汝南至新蔡官道上的过路店，故名。

2022年3月，万金店镇被命名为2021年度河南省卫生乡镇。

平舆县辖乡。1958年建万金店公社，1983年改乡。位于县境东南部，距县城11公里，面积78平方公里，人口4.8万。驻(马店)新(蔡)公路过境，小清河由西北向东南过境。辖万金店、土店、张坡、大郭、厂庙、黄庄、冯郭庄、老宋寨、余营、余庄、周庄、刘小、王寨、茨园14个村委会。农业主产小麦、玉米、大豆、红薯、芝麻、蔬菜，是国家白芝麻生产基地之一。

历史沿革：

明正统年间称万金店，始有万金店之名。

1949年为汝南县二区万金店乡。

1951年属平舆县二区（史寨）。

1955年为平舆县万金店区。

1956年建立万金店中心乡。

1957年称万金店乡。

1958年成立万金店人民公社。

1984年改设万金店乡。

2007年将冯楼村委会划入古槐街道。

2009年撤乡设万金店镇。