地名由来：侗语称“肇”“宰肇”“肇洞”，汉语称肇兴：“肇”指开始，“兴”指兴旺之意，故名。

2023年7月，肇兴镇被列入第三批贵州省乡村旅游重点镇名录。

2020年7月，全国爱国卫生运动委员会重新确认肇兴镇为2020年国家卫生乡镇（县城）。

2017年8月，肇兴镇被国家住房和城乡建设部认定为第二批全国特色小镇。

2015年2月，中央文明委决定授予肇兴镇第四届全国文明村镇称号。

2015年1月，肇兴镇入选第二批美丽宜居小镇示范名单。

肇兴乡位于黎平县城南68公里，北邻永从、顺化乡，东邻水口镇、龙额乡，西南与从江县洛香镇交界。总面积133平方公里，其中耕地12539亩。乡驻地海拔410米，年均气温16.3℃，无霜期288天，年均降水量1200ｍｍ。辖22个行政村，52个自然寨、162个村民小组，总人口21860人，侗、苗、水、汉等民族聚居。其中侗族人口占90%。

乡内主产水稻、油菜、茶油，土特产品主要有大蒜、金银花、棉花、花生。尤以岑所村的大蒜苔、登杠村的金银花最为出名。

肇兴乡民族风情浓郁，有全国第一侗寨――肇兴、全国唯一的侗族生态博物馆――堂安、有省级重点文物保护单位――纪堂鼓楼，还有待开发的皮林溶洞群等众多旅游景点，是全省100个小城镇建设试点之一，其中肇兴和堂安被列为全省20个重点保护和开发的民族村寨，二OO三年被列为全国首批十个民族民间文化保护工程试点之一。目前已有贵州世纪风华投资公司、香港明德创意有限公司等外资企业到肇兴投资开发。

2012年，根据《省人民政府关于同意撤销黎平县肇兴乡龙额乡双江乡设置肇兴镇龙额镇双江镇的批复》（黔府函〔2012〕305号）文件精神，撤销肇兴乡，设置肇兴镇，镇人民政府驻肇兴村。

历史沿革：

清前肇洞属六润侗族地区之一。

民国二十九年（1940年），属永从县。

民国三十年（1941年），属黎平县第二区。

民国三十三年（1944年），属水口区公署。

1950年，属六区。

1957年，为片。

1958年，设立少兴公社。

1983年7月28日，少兴公社更名肇兴公社。

1984年，设立肇兴乡。

1992年1月25日，新平乡和原中潮区的皮林乡并入肇兴乡。

2012年12月，撤销肇兴乡，设置肇兴镇。