地名由来：因境内东西两侧皆为支毛沟，中间高地状如箭头，元末得名“箭头”。明代中叶将“箭”谐音为“店”，故名店头。

2015年12月，陕西省爱国卫生运动委员会命名店头镇为2015年度陕西省省级卫生乡镇。

店头镇是永寿县西南的一块飞地。镇政府驻地距县城44公里。东临漆水河与仪井镇和乾县石牛乡相望；西南部与扶风县天度乡接壤，北至娄敬山北麓与麟游县庙湾乡毗邻。总面积78.3平方公里，境内海拔最高点是娄敬山1200米，最低点是漆水河出境河底600米，平均海拔高度900米。地下有石灰石等矿石。境内有省级文物保护点三处（西汉建信侯娄敬墓，西汉大中大夫陆贾和唐柳公权书写的大司徒刘沔神道碑）。有驻镇单位12个。辖27个行政村，64个村民小组，共4318户，17983人。全镇总耕地44544亩。属南部丘陵台塬沟壑区，以深塬为主，是永寿县自然条件最好的乡镇。因东、西两侧皆为支毛沟，中间高地状如箭头，元末得名“箭头”，明代中叶，将“箭”谐言为“店”，故名店头。1956年3月撤区并乡时，店头乡、梁家乡与乾县的羊毛湾、周家、黎家河、成家河、周家塬合并建立店头乡。1958年10月，店头乡、好寺乡合并建立红星公社。1959年1月改称店头人民公社。1984年6月改称店头乡，同年12月改称店头镇。该镇以农业为主，主产小麦、玉米、油菜、豆类。经济作物有苹果、蔬菜、药材等。养殖业以布尔山羊和獭兔养殖为主。全镇国民经济总值16494万元，农民人均纯收入1650元。土特产有面粉、菜籽油、芝麻、香油、“红富士”苹果、香醋、“白菊牌”卫生纸。辖区面积0.4平方公里。街道长1200米，宽30米，其中车行道12米，两边人行道各9米，柏油路面、路灯30盏。全镇有15个村8303人饮用自来水。12个村有供水点。13个村铺设油路42.16公里。26个村低压电网改造57.5公里。26个村通了程控电话，6个村应用“电视村村通”。有初中1所，完小7所，初小7所，教学点1个。中小学教职工189人，在校学生3218人。每天有汽车客运52个班次，往返县内外，其中往返永寿14次，扶风4次，杨凌34次，咸阳28次，西安28次。每年农历正月二十六，三月二十日、七月七日、十月十日为物资交流会，逢旬三、六、九日为集日，日上市约5000人，摊点700余个，年市场成交额1200多万元。

历史沿革：

明万历年间（1573～1620年），设店头镇。

清乾隆五十六年（1791年）设仪井乡。

民国二十七年（1938年），与仪井镇合并称店仪镇。

民国三十八年（1949年）5月，改称店仪区，下辖店头乡、好畤乡、梁家乡、仪井乡、宋家乡。

1956年3月，撤区并乡时，店头乡、梁家乡与乾县羊毛湾、周家、黎家河、成家河、周家塬等村合并建立店头乡；设仪井乡。

1958年10月，店头乡、好畤乡合并建立红星人民公社；仪井乡改建为明星人民公社。

1959年1月，红星人民公社改称店头人民公社；明星人民公社和卫星（甘井）公社、乾县关头公社合并为关头人民公社。

1961年9月，又设立仪井人民公社。

1984年6月，机构改革时改称店头乡，仪井人民公社改称仪井乡，同年12月改称店头镇。

1998年4月，仪井乡改称仪井镇。

2015年，撤销仪井镇，并入店头镇。