地名由来：藕团乡因乡人民政府驻地盛产莲藕而得名；“团”是村、寨、冲等自然村名的别称。

靖州苗族侗族自治县辖乡。1950年属南区，1956年设藕团乡，1958年改公社，1959年并入新平公社，1961年复社，1982年改藕团苗族公社，1984年改藕团苗族乡，1987年复藕团乡。位于县境西南部，距县城32公里，面积150平方公里，人口0.9万，其中苗族、侗族占89%。乡政府驻藕团。1826省道贯境。辖藕团、三桥、团山、陇团、新寨、潭洞、新街、高营、高坡、老里、康头11个村委会。矿产有煤、金、铝土。有茯苓加工、拼花地板、木材加工等厂。盛产杉木、松木、松脂、埋头鲤鱼、天麻、茯苓、香菇、木耳。每年农历七月十五日有规模盛大的芦笙节。

历史沿革：

清朝时，属寨市乡。

民国二十四年（1935年），属南区寨市乡。

民国二十七年（1938年），属信义乡。

民国三十五年（1946年），属青萝乡。

1956年7月，设藕团乡。

1958年9月，并入新厂公社。

1959年，属新平公社。

1961年，设藕团公社。

1982年，藕团公社改为藕团苗族公社。

1984年9月，藕团苗族公社改为藕团苗族乡。

1987年，藕团苗族乡改为藕团乡。